조직학적 관찰을 위해 새우를 Davidson's fixative1주일간 고정한다. 고정할때는 갑피를 제거할 필요는 없으며 두흉부의 복측을 가위로 조금 잘라 고정액이 잘 들어 가도록 한다. 또는 주사기로 고정액을 두흉부에 주입한다음 고정액에 담그어 두어도 좋다. 고정 후, 두흉부를 입부터 두흉부의 끝까지 4절편으로 잘라 파라핀에 포매한다. 포매된 조직을 3㎛로 자른 H&E염색을 하는데Lymphoid organ이 나오도록 고정한다. 감염새우의 조직학적 변화는 lymphoid organ, 표피의 상피, 아가미 및 위에서 관찰된다. Lymphoid organstromal cell은 대량괴사가 관찰되고, Tubule의 상피 역시 괴사가 일어나 tubular structure가 파괴된다. 표피의 상피는 변성 또는 괴사되는데 변성된 상피에서 많은 수의 원형의 amphophilic 또는 basophilic 핵 내 봉입체가 관찰된다. 봉입체를 가진 핵은 핵막과 봉입체 사이에 공간이 존재하며 nucleoplasm은 핵막 쪽으로 밀려있다. 핵 내 봉입체를 가진 세포 및 변성된 세포는 세포질에 basophilic minute granules을 가지고 있다.  핵내 봉입체는 아가미와 위 상피에서도 관찰이 된다. 변성 또는 괴사된 세포 주위에 조혈세포의 침윤은 관찰되지 않으며 간췌장의 상피에는 변화가 인지되지 않으나 간췌장의 일부 간질세포에는 amphophilic한 핵 내 봉입체가 관찰된다.